据英国广播公司5月12日报道，在台湾“总统府”就台渔民遭射杀向菲律宾下通牒后，菲律宾总统府马拉坎南宫5月12日发表官方声明表示对事件感到悲伤，并称菲律宾马尼拉经济文化办事处驻台代表白熙礼已向家属转达“慰问与道歉”。马英九办公室发言人李佳霏说，白熙礼两天前确实曾向家属表示道歉，但当时被菲律宾总统府否认，所以台湾方面认为这不是菲律宾政府的正式道歉。

　　李佳霏说，如果菲律宾总统府再用如此轻佻的态度来响应，不但毫无诚意，也无助于事件的解决，菲律宾必须为此付出代价。

　　台湾“外交部”也说，无法接受所谓驻台代表已向渔民家属道歉的说法，此举并非代表菲方已道歉。

　　5月11日，马英九要求菲律宾必须在72小时内正式道歉、赔偿损失、尽速彻查事实、严惩凶手以及启动台菲渔业协议谈判。若72小时内未获菲方正面回应，将采取措施抗议。台湾“外长”林永乐说，菲方有一点改善，但仍未符合台湾所提的四项要求。

　　台湾此前表示，倘若在“最后通牒”后得不到回应，将冻结菲律宾劳务申请、召回驻菲代表、以及驱逐菲律宾驻台代表。