波士顿恐袭带来的恐慌和悲情尚未消退之际，波士顿附近的水镇(Watertown)19日凌晨发生重大枪击案，两名嫌犯驾着抢来的多功能休旅车，遭警方出动大批警车追捕。凌晨1时许，双方在水镇广场附近发生激烈枪战，嫌犯还抛出类以手榴弹的爆炸物。其中一名嫌犯伏地被捕，另一人在逃。

警方表示，水镇的警匪枪击案和麻省理工学院(MIT)校园枪击案有关。稍早位于波士顿市边的美国顶尖名校MIT在18日晚传出校园枪击，一名MIT校警遭到枪手射杀，身中多枪，送医后不治。人数不详的枪手携枪逃走。

该校18日晚10时48分发出紧急通知说，校园发生枪击案，要学生待在校舍，不准外出。

美联社报导，剑桥市警局表示，男性校警接到报警，校内有纠纷，随即赶往处理，在一栋建筑外，遭「多发子弹」射杀，送医后不治。目前仍不清楚整个案情。

MIT校报早先紧急通报，「Vassar街32号建筑附近的Stata Center发生枪击案，警方已赶到现场，请所有人员留在室内，静候进一步通知，目前不清楚是否有人受伤。」MIT全校约有1万1000多名学生，一名学生在网上留言，「天哪！这个礼拜发生的事情还不够多吗？」